Biologie des plantes pour l’agro-environnement

Le parcours Biologie des Plantes pour l’Agro-environnement (BiPa) propose une formation pluridisciplinaire centrée sur les connaissances générées à partir de modèles d’étude majeurs comme Arabidopsis thaliana mais aussi à partir de plantes cultivées s’imposant maintenant comme de vrais modèles (riz, maïs, etc.). Notre formation aborde l’ensemble des thématiques végétalistes (biologie du développement, nutrition minérale et métabolisme, adaptation des plantes aux changements climatiques, interactions plantes-microorganismes, écophysiologie). En complément des approches classiques de la biologie, nous mettons aussi l’accent sur la modélisation et la bioinformatique, disciplines actuellement essentielles à la valorisation des données massives générées au quotidien.

Objectifs

Ce parcours se veut à la fois généraliste et de haut niveau. Il a pour objectif de former des étudiants avec de vastes connaissances générales, mais aussi de pointe dans le domaine végétal. A terme, cette formation vous permettra de poursuivre votre formation en recherche fondamentale ou appliquée (Doctorat), ou de concrétiser votre projet professionnel en lien avec les problématiques de l’agriculture moderne.

Ce master s’attache également à rendre autonome les étudiants formés pour faciliter leur intégration dans le monde professionnel au travers d’Unités d’Enseignement dédiées (management et gestion de projet) et de nombreux projets organisés en groupes proposés dans les différentes UE.

A l’issue de la formation, les diplômés BiPa ont les meilleures connaissances et opportunités pour devenir les chercheurs et ingénieurs de recherche de ces prochaines années, qui seront à même de répondre aux défis scientifiques et sociétaux liés au monde végétal (science fondamentale, biotechnologies, changement climatique, agro-écologie).

Contenu de la formation

Liste des Unités d’Enseignement

M1, 1er semestre

• UE communes aux 4 parcours de Biologie des Plantes:
  • Biostatistiques avec R
  • Génétique moléculaire végétale
  • Nutrition des plantes
  • Développement des plantes
  • Interactions plantes-microorganismes
  • Bases d’écophysiologie
• UE spécifiques BiPa:
  • Adaptation à l’environnement et signalisation
  • Biologie Cellulaire et Moléculaire Végétale

M1, 2ème semestre

• UE communes aux 4 parcours de Biologie des Plantes
  • Approches expérimentales de la biologie des plantes
  • Bioinformatique: données et bases de données
  • Synthèse bibliographique
  • Management de projets
• Une UE optionnelle à choisir parmi:
  • Réseaux de gènes-modélisation
  • Amélioration des plantes tropicales et méditerranéennes

• Stage de 4 mois en laboratoire ou en entreprise

M2, 1er semestre

• UE communes aux 4 parcours de Biologie des Plantes:
  • Génétique quantitative
  • Epigénétique chez les plantes
  • Ecophysiologie : du phénotype à l’idéotype
  • BIGOmics, génomique comparative
  • Traitement de données
  • Bioinformatique : construire des requêtes
  • Gestion de projets
• UE spécifiques BiPa :
  • Plantes modèles et modélisation
  • Nutrition minérale et adaptation des plantes aux contraintes abiotiques
  • Analyse de l’expression différentielle de gènes à partir de données RNA-Seq
  • Ecole ThématiqueTransports, Signalisation et Dynamique Membranaires

M2, 2ème semestre

• Analyse critique de l’information scientifique
• Stage de 6 mois en laboratoire ou en entreprise