Interactions Microorganismes-Hôtes-Environnements (IMHE)

La formation IMHE est originale dans l’offre régionale en proposant aux étudiants une formation par la recherche dans le domaine de la microbiologie générale et environnementale, à la fois fondamentale et appliquée.

Le master IMHE vise une connaissance approfondie des systèmes microbiens, abordant aussi bien l’étude des microorganismes en tant que cellules, populations et communautés dans leur environnement, que les interactions avec leurs hôtes (homme, animaux, plantes) et vecteurs. La formation aborde les interactions à l’échelle moléculaire, cellulaire et à l’échelle des communautés microbiennes, ainsi que l’effet des facteurs biotiques et abiotiques sur ces interactions. Elle approfondit le rôle des microorganismes dans le fonctionnement des écosystèmes, naturels et anthropisés. Les volets pratiques et finalisés de la microbiologie sont également traités, notamment les applications de la biomasse et de la diversité microbiennes dans les domaines de l’agriculture, de l’environnement, de la santé et des biotechnologies.

Des combinatoires d’Unités d’Enseignement (UE) permettent de proposer deux profils, l’un tourné vers la « Recherche Fondamentale » (profil 1), le second vers la « Recherche & Développement » (profil 2). Cette formation offre ainsi aux étudiants la possibilité de répondre à des objectifs professionnels diversifiés, avec un fort taux de placement des étudiants en Doctorat (40 à 50%) ou des débouchés professionnels en entreprise ou en laboratoire directement à l’issue de la formation. Les étudiants du profil 2 ont la possibilité d’acquérir une double diplomation en suivant des UE supplémentaires portées par l’IAE de Montpellier (sur sélection de dossier). La formation est ouverte à l’apprentissage.

Cette formation s’adosse à la forte communauté de recherche régionale dans le champ de la microbiologie et s’appuie sur une implication forte de chercheurs, enseignants-chercheurs, et d’industriels de cette communauté présents à Montpellier et plus largement en région Occitanie.

Le Master IMHE s’inscrit dans l’offre de formation qui fait suite à la Licence des Sciences de la Vie, Parcours Microbiologie de l’Université de Montpellier (Faculté des Sciences). Il est ouvert à tous les étudiants issus d’une Licence de Biologie ou des Sciences de la Vie avec une spécialisation en Microbiologie. Il s’inscrit aussi dans une logique de spécialisation en microbiologie pour des étudiants en médecine, pharmacie, odontologie et pour des étudiants-ingénieurs d’écoles en biologie du vivant et en agronomie (comme L’institut Agro).

Mots clés du Master IMHE : micro-organismes, microbiologie, microbiologie environnementale, écologie microbienne, microbiotes, émergence, résistance, adaptation, symbioses, parasitisme, génomique, métagénomique, valorisations microbiennes, bactéries, archées, virus, champignons, microalgues, microorganismes eucaryotes.

Master 1 IMHE

Prochaine réunion de rentrée début Septembre 2025.

La première année M1 de la formation constitue le socle de la formation avec acquisition des fondamentaux en microbiologie générale et en écologie microbienne, elle inclut des TP et une sortie terrain. Les UE à choix permettent aux étudiants de suivre l’un des deux profils sans pour autant que ce choix soit définitif (il est possible de changer de profil à chaque semestre sans que cela ne porte préjudice aux résultats).

La pédagogie par projet et l’innovation pédagogique sont mises en avant. Grâce à une mutualisation de compétences avec le master Bioinformatique de la Faculté des Sciences, et la mise en place du Bioinformatics Learning Lab (BILL), laboratoire d’apprentissage interdisciplinaire innovant, les étudiants sont encouragés à être acteurs de leur formation, en gérant un mini-projet de recherche de A à Z (depuis l’échantillonnage sur le terrain, jusqu’à l’extraction d’ADN, le séquençage et l’analyse de séquences microbiennes, en M1) et en valorisant leurs résultats (publication, présentation en congrès, en M2). Plus d’infos sur BILL et les photos ici.

TP BILL (2021 et 2022)

La formation par la recherche est également permise à travers un stage long en laboratoire ou en entreprise (4 mois) débouchant sur la rédaction d’un mémoire et une soutenance orale devant un jury de spécialistes.

Sortie terrain à Perpignan (M1 2019)

Master 2 IMHE

La seconde année M2 de la formation approfondit les connaissances fondamentales et appliquées, et les compétences associées, initiées en première année. Les étudiants interagissent avec de nombreux chercheurs qui viennent présenter leurs travaux de recherche, autour de thématiques qui traitent des mécanismes moléculaires d’interactions entre microorganismes et hôtes (avec une grande diversité de modèles), du rôle des microorganismes dans les écosystèmes ou de leur valorisation.

Le M2 vise l’acquisition de la démarche de recherche scientifique. Les étudiants travaillent sur les ressources bibliographiques (recherche, compréhension, critique et synthèse bibliographiques) et les méthodes pédagogiques de communication et réalisent un stage long (6 mois) avec rédaction d’un rapport scientifique et une soutenance.

Au cours de la formation, plusieurs UE sont dédiées à l’insertion professionnelle, dans lesquelles les étudiants travaillent sur leur projet professionnel et personnel.

Les étudiants IMHE présentent leur résultats en congrès (MicrobiOccitanie 2019; JFV 2024)

A l’issue du M2, les étudiants passent les concours d’entrée en Ecole Doctorale, notamment l’ED GAIA, ou peuvent s’insérer directement dans la vie active en en laboratoire de recherche public ou dans les secteurs R&D en entreprise ; ces choix d’orientation sont permis grâce au choix de profil du M1/M2.

Remise des diplômes 2023