La formation IMHE ʻInteractions Microorganismes/Hôtes et Environnementsʼ est originale et unique dans l’offre régionale en proposant aux étudiants une formation par et pour la recherche dans le domaine de la microbiologie.

Le master IMHE vise une connaissance approfondie des systèmes microbiens avec une démarche intégrative, abordant aussi bien l’étude des microorganismes en tant que cellules, populations et communautés, que leurs interactions avec leurs hôtes (homme, animaux, plantes) et vecteurs, et leurs rôles dans le fonctionnement des écosystèmes (aquatiques et terrestres, naturels et anthropisés). La formation aborde les interactions à l’échelle moléculaire, cellulaire et à l’échelle des communautés microbiennes, ainsi que l’effet des facteurs biotiques et abiotiques sur ces interactions.  Les volets pratiques et finalisés de la microbiologie sont également traités, notamment les applications de la biomasse et de la diversité microbiennes.

Des combinatoires d’Unités d’Enseignement (UE) permettent de proposer deux profils, l’un tourné vers la « Recherche Fondamentale » (profil 1), tandis que l’autre est plus axé vers la « Recherche & Développement » (profil 2). Cette formation offre ainsi aux étudiants la possibilité de répondre à des objectifs professionnels diversifiés, avec un fort taux de placement des étudiants en Doctorat (environ 50%) ou des débouchés professionnels en entreprise directement à l’issue de la formation.

Cette formation s’adosse à la forte communauté de recherche régionale dans le champ de l’étude des microorganismes et s’appuie sur une implication forte de chercheurs/ enseignants-chercheurs, et d’industriels de cette communauté présents à Montpellier et plus largement en région Occitanie.

Le Master IMHE s’inscrit dans l’offre de formation qui fait suite à la Licence des Sciences de la Vie, Parcours Microbiologie de l’Université de Montpellier (Faculté des Sciences, Département Biologie-Mécanismes du Vivant). Il est ouvert à tous les étudiants issus d’une Licence de Biologie ou des Sciences de la Vie avec une spécialisation en Microbiologie. Il s’inscrit aussi dans une logique de spécialisation en microbiologie pour des étudiants en médecine, pharmacie, odontologie et pour des étudiants-ingénieurs d’écoles en biologie du vivant et en agronomie (comme Montpellier SupAgro).

Responsables du parcours IMHE: Anne-Sophie Gosselin

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Les étudiants IMHE organisent le congrès MicrobiOccitanie 2019

Les étudiants IMHE organisent le congrès MicrobiOccitanie 2019

Mots clés du Master IMHE : Microorganismes, Microbiologie environnementale, Ecologie microbienne, Microbiotes, Emergences, Résistances, Adaptations, Symbioses, Parasitisme, (Méta)génomique, Valorisations microbiennes, Bactéries, Archées, Virus, Champignons, Microorganismes eucaryotes.

Master 1 IMHE

Réunion de rentrée prévue le vendredi 4 septembre 2020 (à confirmer) et début des enseignements le lundi 7 septembre 2020.

Promo M1 2019-2020

Les UE à choix permettent aux étudiants de suivre l’un des deux profils sans pour autant que ce choix soit définitif. En effet, l’appartenance au même parcours (IMHE) permet à chaque semestre de changer de profil sans que cela ne porte préjudice aux résultats.

La pédagogie par projet et l’innovation pédagogique sont mises en avant. Grâce à une mutualisation de compétences avec le master Bioinformatique, Connaissances, Données (BCD) de la Faculté des Sciences, et la mise en place du BioInfoLearning Lab, laboratoire d’apprentissage interdisciplinaire innovant, les étudiants sont encouragés à être acteurs de leur formation, en gérant un mini-projet de recherche de A à Z (depuis l’échantillonnage sur le terrain, jusqu’à l’extraction, le séquençage et l’analyse de séquences microbiennes, en M1) et de valoriser leurs résultats (publication, présentation en congrès, en M2). 

Projet BILL: échantillonnages, extractions génomiques et analyses bioinfo

La formation par la recherche est également permise à travers un stage long en laboratoire (4 mois) débouchant sur la rédaction d’un mémoire et une soutenance orale devant un jury de spécialistes.

Sortie terrain à Perpignan (M1 2019)

Profil 1 (recherche fondamentale)

UE obligatoire :

Groupement à choix = 3 UE parmi :

  • Ecologie microbienne (HMBA110)
  • Micro-organismes phytopathogènes (HMBA102)
  • Aspects immunologiques et génétiques des interactions hôtes/micro-organismes (HMBA111)
  • Emergence-Résistance-Adaptations (HMBA112)

Groupement à choix = 1 UE parmi :

  • Bases en traitement de données biologiques (HMBE101M)
  • Traitement avancé des données biologiques (HMBE102M)

Groupement à choix = 1 parmi :

  • Phylogénie et évolution (HMBE111M)
  • Bases moléculaires des maladies infectieuses  (HMBI101M)

Profil 2 (recherche et développement)

Groupement obligatoire :

  • Anglais scientifique (HMBA101L)
  • Ecologie microbienne (HMBA110)
  • Biotechnologies et ingénierie métaboliques (HMBA113)
  • Microbiologie et toxicologie pour la sécurité des aliments (HMBA114)

Groupement à choix : 1 UE parmi

  • Micro-organismes phytopathogènes (HMBA102)
  • Emergence-Résistance-Adaptations (HMBA112)

Groupement à choix : 1 UE parmi

  • Bases en traitement de données biologiques (HMBE101M)
  • Traitement avancé des données biologiques (HMBE102M)

2 UE obligatoires pour les Profils 1 et 2 :

  • Ecologie microbienne moléculaire  (HMBA205)
  • Stage M1 MHE de 4 mois (HMBA206)

Profil 1 (recherche fondamentale)

Groupement à choix : 1 UE parmi

  • Parasitologie intégrative (HMBA208)
  • Bases moléculaires des maladies infectieuses 2 (HMBA207)

Profil 2 (recherche et développement)

Groupement à choix : 2 UE parmi

  • Bioénergie (HMBA209M)
  • MicrobiEAU (HMBA221)
  • Les pollutions dans les systèmes agro-environnementaux et les zones urbaines (HMBA210)

Master 2 IMHE

La seconde année du Master IMHE approfondit les connaissances fondamentales et appliquées, et les compétences associées, initiées en première année.

Les étudiants interagissent avec de nombreux chercheurs qui viennent présenter leurs travaux de recherche, autour de thématiques qui traitent des mécanismes moléculaires d’interactions entre microorganismes et hôtes (avec une grande diversité de modèles), du rôle des microorganismes dans les écosystèmes ou de leur valorisation.

Le M2 vise l’acquisition de la démarche de recherche scientifique. Les étudiants travaillent sur les ressources bibliographiques (recherche, compréhension, critique et synthèse bibliographiques) et les méthodes pédagogiques de communication et réalisent un stage long (6 mois) avec rédaction d’un rapport scientifique et soutenance.

Les étudiants IMHE présentent leur résultats en congrès (M2 2019)

A l’issue du M2, les étudiants passent les concours d’entrée en Ecole Doctorale, notamment GAIA dont relève le Master, ou peuvent s’insérer dans les secteurs R&D en entreprises ; ces choix d’orientation sont permis par la continuité des 2 profils du M1.

Profil 1 (recherche fondamentale)

Groupement d’UE obligatoires :

  • Analyse critique et synthèse d’articles scientifiques (HMBA316)
  • Interactions des micro-organismes avec l’homme, l’animal et la plante (HMBA317)
  • Rôle des micro-organismes dans le fonctionnement des écosystèmes-1 (HMBA318M)
  • Rôle des micro-organismes dans le fonctionnement des écosystèmes-2 (HMBA319M)
  • Culture scientifique et controverses (HMBE301M)

Groupement à choix = 1 UE parmi :

  • Anglais scientifique (HMBA301L)
  • FLE (Français Langue Etrangère) (HMBA302L)

Groupement à choix = 7,5 ECTS parmi :

  • Maladies émergentes et changement global (HMBE3A7M)
  • Interactions et signalisations (HMBA305)
  • Phylogénie approfondie : méthodes et applications en évolution (HMBE377M)
  • Bactériologie – virologie (HMBI301M)

Profil 2 (recherche et développement)

Groupement obligatoire :

  • Analyse critique et synthèse d’articles scientifiques (HMBA316)
  • Interactions des micro-organismes avec l’homme, l’animal et la plante (HMBA317)
  • Rôle des micro-organismes dans le fonctionnement des écosystèmes-1 (HMBA318M)
  • Rôle des micro-organismes dans le fonctionnement des écosystèmes-2 (HMBA319M)
  • Culture Scientifique et Controverses (HMBE301M)

Groupement à choix = 1 UE parmi :

  • Anglais scientifique (HMBA301L)
  • FLE (Français Langue Etrangère) (HMBA302L)

Groupement à choix = 3 UE parmi :

  • Gestion de projets (HMBA308)
  • Bioconversions des agroressources (HBMA341)
  • Exploitation de la diversité des micro-organismes en bioproduction (HMBA321)
  • Ingénierie de la production des protéines recombinantes (HMBA320)

Profil 1 (recherche fondamentale)

  • Stage M2 IMHE de 6 mois, en laboratoire ou en entreprise, en France ou à l’expatriation (HMBA403)
  • Professionnalisation et insertion (HMBE434M)

Profil 2 (recherche et développement)

  • Stage en entreprise (HMBA409)
  • Création et montage de projets en R & D (HMBA404)

Remise des diplômes 2019