Projet BILL 2024

Cette année encore, les étudiants de M1 des masters IMHE, Bioinformatique et EcoEpi ont participé de manière collaborative au projet d’innovation pédagogique BILL (Bioinformatics Learning Lab). Encadrés par une équipe pluridisciplinaire (Anne-Sophie Gosselin-Grenet, Jean-Christophe Avarre, Anna-Sophie Fiston-Lavier, Marie-Ka Tilak, Arnaud Soulier, Catherine Breton), les étudiants ont travaillé en groupe inter-master et partagé leurs compétences autour d’un vrai projet de recherche: l’étude de l’évolution génomique du Cyprinid herpesvirus 3 (CyHV-3), l’agent étiologique de l’herpèsvirose de la carpe, qui a émergé il y a 25 ans et s’est depuis répandu dans le monde entier, posant des problèmes sanitaires dans de nombreux pays. Après avoir réalisé l’extraction des génomes viraux à partir de cellules infectées au cours de passages en série, les étudiants ont séquencé l’ADN viral via une technologie de séquençage de dernière génération (Oxford Nanopore(R)), puis analysé bioinformatiquement les données de séquençage pour identifier la dynamique des variations génomiques.